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[Liste des modules](#sommaire)
    
## Préambule
    
    Avec le soutien de l’Initiative d’Excellence IdEx Bordeaux, au travers des programmes Défi 
    Numérique et STEP (Soutien à la Transformation et à l’Expérimentation Pédagogiques), un groupe
    d’enseignants issus de l’Université de Bordeaux, Bordeaux-INP et Bordeaux Sciences Agro a créé une
    communauté d’enseignants de la statistique (CBEstd) autour de deux axes :

*    Certificat de culture statistique et traitement des données (2Cstd)
        
    *    Découverte de R avec Begin’R

Le logiciel R est un logiciel libre et gratuit de traitement de données et d’analyse statistique.
    Déjà incontournable dans l’enseignement et la recherche, il est en plein développement dans le monde
    professionnel et sa maîtrise par les jeunes diplômés est devenue un réel atout pour leur insertion
    en entreprise.

Une séquence pédagogique autour de la prise en main de R, de la manipulation de données et de la
    mise en œuvre des principales approches de statistiques descriptives et inférentielles vous est
    proposée. Vous en trouverez le [sommaire](#sommaire) ci-dessous.
    
## Sommaire 
    
    En cliquant sur le symbole "+", vous ferez apparaitre l'ensemble des capsules relatives à chaque section
    
    :Objectifs Prise en main de R {#priseenmain, toggle=collapse, title-class-display=hidden}
    
        :Truc {#caps_1_1_installation, title-display=hidden} 
        
            [Téléchargement et installation du logiciel R et de RStudio](caps_1_1_installation.html) 
        
        :Truc {title-display=hidden}
            
            [Premiers pas avec RStudio](caps_1_2_premiers_pas.html)
            
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Les variables](caps_1_3_variables.html)
            
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Utilisation de fonctions](caps_1_4_fonctions.html)
        
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Rubrique d'aide](caps_1_5_aide.html)
        
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Installation de packages](caps_1_6_packages.html)
        
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Gestion des scripts](caps_1_7_scripts.html)
            
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Editer des rapports](caps_1_8_rapports.html)
            
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Editer des rapports Rmarkdown](caps_1_9bis_rapports_rmd.html)
        
        
    :Objectifs Manipulation de données {#manipulation, toggle=collapse, title-class-display=hidden}
     
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Présentation du jeu de données](caps_2_1_presentation_donnees_melons.html) : présentation du jeu
        de données "Melons" sur lequel sont basés les exemples de cette partie
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Conversion Excel -> CSV](caps_2_2_conversion_exel_vers_csv.html) : Comment convertir un fichier Excel en un fichier .csv
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Importation sous R d'un fichier CSV](caps_2_3_importation_csv.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Solutions aux problèmes d'importation d'un fichier CSV](caps_2_4_probleme_importation_csv.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Caractéristiques d'un jeu de données](caps_2_5_caracterisitique_jeu_donnees.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Vérification du type de variables](caps_2_6_verification_type_variables.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Corriger la nature d'une variable](caps_2_7_corriger_type_variables.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Transformantion d'un jeu de données](caps_2_8_transformer_jeu_donnees.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Accéder à un sous-ensemble de variables et/ou d'individus](caps_2_9_extraire_sous_ensemble.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Extraire un sous-ensemble avec la fonction
        "subset"](caps_2_10_extraire_sous_ensemble_subset.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Sauvegarder un jeu de données](caps_2_11_sauvegarder_jeu_donnees_csv.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Manipulation d'un tableau de données (dataframe)](caps_2_13_dataframe.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Exercice bilan](caps_2_12_exercice_bilan_manipulation_jeu_donnees.html)
        
    :Objectifs Statistiques descriptives univariées {#univ, toggle=collapse, title-class-display=hidden}
    
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Description des variables](caps_uni_1_descriptif.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Description de variables qualitatives](caps_uni_quali_1.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Représentation de variables qualitatives](caps_uni_quali_2.html)

:Truc {title-display=hidden} 
        
            [Description paramètrique de variables quantitatives](caps_uni_3_quanti_1.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Représentation de variables quantitatives](caps_uni_3_quanti_2.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Exercice bilan](caps_uni_3_quanti_3.html)
        
    :Objectifs  Statistiques descriptives bivariées {#biv, toggle=collapse, title-class-display=hidden}   
    
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Téléchargement et présentation des données](caps_4_1_objectifs&donnees.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Croiser deux variables qualitatives](caps_4_2_quali_quali.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Croiser une variables quantitative et une variable qualitative](caps_4_3_quali_quanti.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Croiser deux variables quantitatives](caps_4_4_quanti_quanti.html)
        
    :Objectifs  Tracer des graphiques {#graph, toggle=collapse, title-class-display=hidden} 
    
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Présentation des graphiques de base](caps_5_1_graphiques_de_base.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Réaliser plusieurs graphiques en un
        seul](caps_5_2_realiser_plusieurs_graphiques_en_un_seul.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Gestion des symboles, couleurs, titre et
        étiquettes](caps_5_3_gestion_symboles_couleurs_titre_etiquettes.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Paramètres spécifiques de la fonction "boxplot"](caps_5_4_parametres_specifiques_boxplot.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Exercice bilan](caps_5_5_exercice_bilan_personnalisation_graphiques.html)
        
    :Objectifs Calculs de probabilités {#proba, toggle=collapse, title-class-display=hidden}
    
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Loi normale](caps_6_1_loi_normale.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Loi binomiale](caps_6_4_loi_binomiale.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Lois continues](caps_6_2_lois_continues.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Lois discrètes](caps_6_5_lois_discretes.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Normalité : graphiques quantile-quantile](caps_6_3_normalite_graphique_quantile_quantile.html)

:Truc {title-display=hidden} 
        
            [Exercice bilan](caps_6_6_exercice_bilan.html)

:Objectifs Tests {#tests, toggle=collapse, title-class-display=hidden}      
    
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Introduction : exemple du Khi-deux](caps_7_1_objectifs&intro_chi-deux.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Tests de conformité et intervalles de confiance](caps_7_2_conformite_para.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Tests d'ajustement à une distribution théorique](caps_7_3_conformite_distrib.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Tests paramétriques d'homogénéité](caps_7_4_homogeneite_para.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Tests non-paramétriques d'homogénéité](caps_7_5_homogeneite_non_para.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Tests d'indépendance de deux variables qualitatives](caps_7_6_indep.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Tests de corrélation de deux variables quantitatives](caps_7_7_corr.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Résumé](caps_7_8_resume.html)
        
    :Objectifs Régression linéaire simple {#regsimple, toggle=collapse, title-class-display=hidden}
    
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Approche descriptive préliminaire](caps_8_1_regression_lineaire_simple_description.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Mise en oeuvre](caps_8_2_regression_lineaire_simple_mise_en_oeuvre.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Représentation graphique des
            résultats](caps_8_3_regression_lineaire_simple_representation_graphique.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Prédiction](caps_8_4_regression_lineaire_simple_prediction.html)
        
    :Objectifs Régression linéaire multiple {#regmul, toggle=collapse, title-class-display=hidden}     
    
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Approche descriptive préliminaire](caps_9_1_regression_lineaire_multiple_description.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Mise en oeuvre](caps_9_2_regression_lineaire_multiple_mise_en_oeuvre.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Affiner le modèle](caps_9_3_regression_lineaire_multiple_affiner.html)
        
    :Objectifs Structure algorithmiques et fonctions {#algo, toggle=collapse, title-class-display=hidden}
    
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Préambule : de l'algorithme au programme](caps_algo_1_de_l_algo_au_programme.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Les opérateurs](caps_algo_2_operateurs.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Structures algorithmiques](caps_algo_3_structures_algorithmiques.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Structures alternatives](caps_algo_4_structures_test.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Structures itératives](caps_algo_5_structures_iteratives.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Fonctions](caps_algo_6_fonctions.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Exercices bilan](caps_algo_7_exercice_bilan_programmation_r.html)

:Objectifs ANOVA {#anova, toggle=collapse, title-class-display=hidden}
    
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [ANOVA à un facteur : représentations graphiques](caps_12_1_anova1_gestion_graphiques.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [ANOVA à un facteur : Réalisation et Vérification des
        hypothèses](caps_12_2_anova1_hypotheses.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [ANOVA à un facteur : Récupération des résultats du tableau
        d'ANOVA](caps_12_3_anova1_resultats.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [ANOVA à un facteur : Tests de comparaison post-hoc](caps_12_4_anova1_posthoc.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [ANOVA à plusieurs facteurs](caps_12_5_anova_mult_posthoc.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Exercice bilan](caps_12_6_anova_exbilan.html)
        
    :Objectifs Plans d'expériences {#plexp, toggle=collapse, title-class-display=hidden}
    
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Générer un plan d'ordre 1](caps_11_1_generer_un_plan_ordre_1.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Générer un plan d'ordre 2](caps_11_2_generer_un_plan_ordre_2.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Ajouter les réponses](caps_11_3_plans_experiences_ajout_reponse.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Analyse qualitative : graphiques des effets](caps_11_4_plans_experiences_graphiques_effets.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Analyse quantitative : régression et ANOVA](caps_11_5_plans_experiences_regression_anova.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Plans factoriels fractionnaires : interprétation et plans
            complémentaires](caps_11_6_plans_experiences_interpretation_fractionnaire_complementaire.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Isoréponses](caps_11_7_plans_experiences_isoreponses.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Exercices bilan](caps_11_8_exercice_recap_plans_exp.html)
        
    :Objectifs Graphiques 3D {#3D, toggle=collapse, title-class-display=hidden}  
    
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Graphiques 3D statiques](caps_10_1_graphiques_3d_statique.html)
        
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Graphiques 3D dynamiques](caps_10_2_graphiques_3d_dynamique.html)
    
    :Objectifs Analyses multivariées (ACP) {#ACP, toggle=collapse, title-class-display=hidden}    
    
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Introduction à l'ACP](caps_13_1_acp_introduction.html)
            
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Choix de la métrique](caps_13_2_acp_metrique.html)
            
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Mise en place de l'ACP](caps_13_3bis_acp_mise_en_place_acp.html)
            
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Matrice de corrélation](caps_13_3_acp_matrice_correlation.html)
            
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Valeurs propres](caps_13_4_acp_valeurs_propres.html)
            
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Cercle de corrélation](caps_13_5_acp_cercle_correlation.html)
            
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Graphique des individus](caps_13_6_acp_graphique_individus.html)
            
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Exercice bilan ACP](caps_13_7_acp_exercice_bilan.html)
            
            
    :Objectifs classification non supervisée (CAH et Kmeans) {#classification, toggle=collapse, title-class-display=hidden}    
    
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Introduction à la classification non supervisée](caps_14_1_classif_non_supervisee_introduction.html)
            
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [Introduction à la classification ascendante hiérarchique (CAH)](caps_14_2_cah_introduction.html)
            
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [CAH : dendrogramme](caps_14_3_cah_dendrogramme.html)
            
        :Truc {title-display=hidden} 
        
            [CAH : exercice bilan](caps_14_4_cah_exercice_bilan.html)

:Truc {title-display=hidden}

[Introduction à la classification par la méthode des centres mobiles (Kmeans)](caps_14_5_kmeans_introduction.html)   
            
        :Truc {title-display=hidden}

[Mise en oeuvre de la classification par la méthode des centres mobiles (Kmeans)](caps_14_6_kmeans_mise_en_oeuvre.html) 
            
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[classification par la méthode des centres mobiles : exercice bilan ](caps_14_7_kmeans_exercice_bilan.html) 
            
## Membres du groupe

|Nom|Fonction|Etablissement|
|---|--------|-------------|
|[Florent Arnal](mailto:florent.arnal@u-bordeaux.fr)|Enseignant|IUT de Bordeaux (Université de Bordeaux)|
|Lionel BOMBRUN|Enseignant-chercheur|Bordeaux Sciences Agro|
|Cécile CABASSON|Enseignant-chercheur|Collège Science et Technologie (Université de Bordeaux)|
|Jean-Pierre DA COSTA|Enseignant-chercheur|Bordeaux Sciences Agro|
|Cécile DANTZER|Enseignant-chercheur|Collège Sciences de l’Homme (Université de Bordeaux)|
|Robin GENUER|Enseignant-chercheur|ISPED (Université de Bordeaux)|
|Marthe-Aline JUTAND|Enseignant-chercheur|Collège Sciences de l’Homme (Université de Bordeaux)|
|Marie LEBRETON|Enseignant-chercheur|Collège DSPEG (Université de Bordeaux)|
|Sébastien MOUTAULT|Enseignant|IUT de Bordeaux (Université de Bordeaux)|
|Jérôme SARACCO|Enseignant-chercheur|ENSC (Bordeaux-INP)|
|Raphaëlle SAVOIRE|Enseignant-chercheur|ENSCBP (Bordeaux-INP)|

## Contact
    
    [Florent Arnal](mailto:florent.arnal@u-bordeaux.fr)